Home  | Impressum | Sitemap | KIT

Bioinformatik Sommersemester 2014 im Modul 4

Bioinformatik Sommersemester 2014 im Modul 4
Ansprechpartner:

Tilman Lamparter, Jörg Kämper, Johannes Gescher u.a.

Links:

Unterlagen zur 2015 Veranstaltung finden Sie hier.

Für die Übungen sind 8 Gruppen vorgesehen. Die Gruppeneinteilung finden Sie unten.

Für die Übungen brauchen je zwei Studierende ein Notebook mit WLAN Zugang.Bitte sprechen Sie ich innerhalb der Gruppe ab und melden sich rechtzeitig bei mir (TL), falls die eigenen Notebooks nicht ausreichen. Bitte installieren Sie rechtzeitig die unten aufgelisteten Programme.

Zu den Übungen Sequenzvergleiche und Phylogenie

Zu den Übungen "Klonierung" 

 

Zeitplan für Vorlesungen und Übungen

Tag Uhrzeit Hörsaal Thema Dozent
Freitag, 13. Juni 2014 9:45-11:15 Geb. 30.21 Gerthsen HS Paarweises alignment, BLAST Lamparter
Freitag, 20. Juni 2014 9:45-11:15  Geb. 30.21 Gerthsen HS  Multiples alignment, Phylogenie Lamparter
Montag, 23. Juni 2014 9:45-11:15  Geb 10.50 Großer HS Proteine (zum Praktikum) Fischer
Dienstag, 24. Juni 2014 11:30-13:00 Geb. 10.11 Hertz In silico Protein Charakterisierung, 3D Gescher
  14:00-18:00 versch. Orte Übungen Gruppen 1-4  
Mittwoch, 25. Juni 2014 9:45-11:15 Geb. 30.22 Gaede HS Yeast Screening (zum Praktikum) Requena
  14:00-18:00 versch. Orte Übungen Gruppen 1-4  
Donnerstag, 26. Juni 2014 11:30-13:00 Geb. 10.91 Grashof HS In silico Klonierung Kämper
  14:00-18:00 versch. Orte Übungen Gruppen 1-4  
Montag, 30. Juni 2014 9:45-11:15 Geb 10.50 Großer HS Yeast 2 Hybrid (zum Praktikum) Kämper
Dienstag, 1. Juli 2014 11:30-13:00 Geb. 50.31 HS 107  Funktionelle Genomik Fokina
  14:00-18:00 versch. Orte Übungen Gruppen 5-8  
Mittwoch, 2. Juli 2014 9:45-11:15 Geb. 30.22 Gaede HS High throughput sequencing Armant
  14:00-18:00 versch. Orte Übungen Gruppen 5-8  
Donnerstag, 3. Juli 2014 14:00-18:00 versch. Orte Übungen Gruppen 5-8  

 

Übungen

Die Übungen müssen bis 10. Juli per Email oder Dropbox bei dem Betreuer abgegeben werden.

Tag Uhrzeit Thema Dozent, Gruppen Raum Dozent, Gruppen Raum
Dienstag, 24. Juni 2014 14:00-18:00 Alignment Lamparter 1,2 10.40 HS 1 Fan 3,4 10.40 Raum 114, 1. Stock
Mittwoch, 25. Juni 2014 14:00-18:00 Protein Gescher 1,2   Fokina 3,4  
Donnerstag, 26. Juni 2014 14:00-18:00 Klonierung Kämper 1,2  30.44 Raum 007 EG Dötsch 3,4  30.44 Raum 007 EG
Dienstag, 1. Juli 2014 14:00-18:00 Alignment Lamparter 5,6 10.40 HS 1 Fan 7,8 10.40 Raum 114, 1. Stock
Mittwoch, 2. Juli 2014 14:00-18:00 Protein Gescher 5,6   Fokina 7,8  
Donnerstag, 3. Juli 2014 14:00-18:00 Klonierung Kämper 5,6  Raum 007 EG Dötsch 7,8  

 

 

Programme

Ape http://biologylabs.utah.edu/jorgensen/wayned/ape/
Pymol http://pymol.org/educational/
Muscle http://www.drive5.com/muscle/downloads.htm
Phylip

http://evolution.genetics.washington.edu/phylip/getme.html

ClustalX2 http://www.clustal.org/clustal2/

 

Gruppeneinteilung

 

Gruppe 1            

Sabrina Gfrerer

Anna Loreth

Berit Nauerth

Sebastian  Schieß

Christine Seemann

Donya   Shapoori

Kathrin  Stricker

Pia Sophie Freidel

Jasmin   Frietsch

Hannah Heinrich    

 

Gruppe 2            

Jeannette Kappenberger

Anja Weiss

Jaana Westmeier

Jacqueline  Mann

Cathrin  Ott

Sören  Seitz

Nahla  Isso

Nathalie  Müller

Julia Chalupsky

              

Gruppe 3            

Natalie  Grüdl

Annette Meynerts

Rebecca Maria  Neun

Juliette  Dassow

Ruben  Gärtner

Steffen  Heck

Annika  Himmelsbach

Philipp  Sauerland

Konstantin Keller

Thomas Walter

 

Gruppe 4            

Qing Lei

Marjorie Schmid

Lisa Schreiber

Cornelius Schubert

Sebastian Vogel

Jonas Waber

Julia Weber

Mouhannad Moulla

              

Gruppe 5            

Sascha  Seidt

Anne-Sophie Seiffert

Anna Agathe Bayer

Alex Fenchel

Rima Siauciunaite

Lukas Spottke

Thomas Stümpfl

Gulnara Datukischvili

              

Gruppe 6            

Sebastian Thomas  Kühnl

Patrick  Bitterwolf

Svenja  Hansson

Tim  Höschele

Anika Lipphardt

Elena Muñoz Perez-Vico

Jannis Julian  Zarges

Fabian Zimmerer

       

Gruppe 7            

Miriam Edel

Lasse Faber

Daniel Härrer

Ina   Kolb

Bryan Lotz

Laura-Alina  Philipp

Mischa  Selig

Katja Irina  Berghaus

Ilsa-Maria  Daumann

              

Gruppe 8            

Lisa  Bergheimer

Lia Heiser

Christian Jonas  Lapp

An Phuc Pham

Tamara Treptow

Jan Lars Rüping

Lara  Stelmaszyk

Nora Weber

Julia Weiß

 

letzte Änderung 22.06.2014