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Master Praktikum Protein Kristallisation Wintersemester 2014 2015

proteinkristalle

 

 Erste Folien zur Vorlesung
 Phytochrom Folien
 Photolyase Folien
 Pymol

 

 

Seminarraum 002 und Laborräume der Botanik 1, Gebäude 10.40

Im Praktikum werden zunächst die Versuche 1,3,6,7,8 unnd 9 aus dem Buch "Protein Crystallization" von Terese M. Bergfors (2008) durchgeführt. Beschreibungen im Buch  (hier klicken für Internet Version) ab Seite 355.

Sie führen dann Kristallisationsversuche mit bakteriellen Phytochrome bzw. Photolyasen durch. Die Proteine werden im Praktikum exprimiert und gereinigt. Eine Fragestellung ist, ob Photolyase Kristalle im Licht anders kristallisieren als im Dunkeln. 

Seminar: Thema 1-8 sind Themen aus dem Kristallisationsbuch von S. Doublie: Macromolecular Crystallography Protocols Band 1+2, 2007
Band_1.pdf und Band_2.pdf 

Jeder Studierende erhält ein Thema.

Thema 1: A Generic Method for the Production of Recombinant Proteins in Escherichia coli Using a Dual Hexahistidine-Maltose-Binding Protein Affinity Tag. Joseph E. Tropea, Scott Cherry, Sreedevi Nallamsetty, Christophe Bignon, and David S. Waugh     Bd. 1,pp. 1-20

Thema 2: Protein Engineering. Sonia Longhi, François Ferron, and Marie-Pierre Egloff; Bd. 1,pp. 59-90

Thema 3: Production of Selenomethionyl Proteins in Prokaryotic and Eukaryotic Expression Systems. Sylvie Doublié; Bd. 1, pp. 91-108

Thema 4: Screening and Optimization Methods for Nonautomated Crystallization Laboratories. Terese Bergfors; Bd. 1, pp. 131-152

Thema 5: Improving Marginal Crystals. Charles W. Carter, Jr. and Madeleine Riès-Kautt; Bd. 1, pp. 153- 174

Thema 6: Cryocrystallography  of  Macromolecules: Practice and Optimization. Elspeth Garman and Robin L. Owen; Bd. 2, pp.        1-18

Thema 7: Characterizing a Crystal From an Initial Native Dataset. Michael R. Sawaya ; Bd. 2, pp. 95-120

Thema 8: Molecular  Replacement. Eric A. Toth; Bd. 2, pp.        121-148

 

Die Themen sind unter "Seminar" aufgelistet. An den jeweiligen Tagen stellen die Teilnehmer den zugeteilten Artikel vor. Dauer 15-30 min. 

 

  Vorlesung 10:00-12:00 Seminar 10:00-12:00
     
Montag, 20. Oktober 2014 Einführung  
Dienstag, 21. Oktober 2014  --  --
Mittwoch, 22. Oktober 2014 Sicherheit, Laborbesprechung, Kristallisation 1  
Donnerstag, 23. Oktober 2014 Laborbesprechung, Kristallisation 1  
Freitag, 24. Oktober 2014 Laborbesprechung, Kristallisation 1
Montag, 27. Oktober 2014 Laborbesprechung, Phytochrom  
Dienstag, 28. Oktober 2014  --  --
Mittwoch, 29. Oktober 2014 Laborbesprechung, Phytochrom  
Donnerstag, 30. Oktober 2014   9:00-10:30 Thema 1 und 2
Freitag, 31. Oktober 2014   9:00-11:00 Thema 3 und 4
Montag, 3. November 2014 Laborbesprechung, Photolyasen   
Dienstag, 4. November 2014  --  --
Mittwoch, 5. November 2014   Thema 5 und 6
Donnerstag, 6. November 2014   Thema 7 und 8
Freitag, 7. November 2014    
Montag, 10. November 2014 Kristallisation 2  
Dienstag, 11. November 2014
 
Mittwoch, 12. November 2014    
Donnerstag, 13. November 2014   Referate
Freitag, 14. November 2014   Klausur

 

 

 

Detaillierter Zeitplan für Praktikum in pdf

 

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