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Chemische Biologie für Fortgeschrittene 2014 2015

Modul im 7. Semester (1. Semester Master), das Medul besteht aus vielen Teilen, hier nur Information zu "Protein Kristallisation"
crystals

Block E: Protein Kristallisation

Zhang Fan und Tilman Lamparter

 

Qualifikationsziele

Die Studierenden werden in die Praxis der Proteinkristallisation eingeführt. Der erste Flaschenhals besteht in der Expression und Reinigung, der zweite in der Kristallisation, der dritte in der Diffraktion und Lösung des Phasenproblems. Die Grundlagen dazu werden in der Vorlesung vermittelt.

Inhalt

Ziel der Kristallisation. Klonierung Expressionsvektoren; Protein Reinigung; Screening Konzepte, Optimierung; Cryo-Protektion; Diffraktion, Strahlenquellen; Lösung des Phasenproblems; Refinement; Visualisierung.

Vorlesung

4 Doppelstunden

 

ACHTUNG: Alle Vorlesungen CS, Geb. 30.44, Seminarraum der Physikalischen Chemie, 4. OG

 

Dienstag 2.12.2014, 9:30 bis 11:00

Mittwoch 3.12.2014, 8:30 bis 10:00

Dienstag 9.12.2014, 9:30 bis 11:00

Mittwoch 10.12.2014, 8:30 bis 10:00


 

 

Hier finden Sie Unterlagen zur Vorlesung. Zum besseren Verständnis sollten Sie Pymol auf Ihrem Notebook bzw. Computer installieren. Einige Dateien lassen sich mit Pymol öffnen, mit F1, F2 etc kann man sich durch die Struktur bewegen.

Pymol Windows

Pymol Linux

Pymol Mac bitte nachfragen

Folien Kristalle PSII Phytochrom Photolyase

PSII Pymol

Photolyase PhrA Pymol

Photolyase PhrB Pymol

Folien über weitere Methoden

 

Praktikum

2 Wochen, 10 Plätze

 

Montag, 15. Dezember 2014 9:00 bis 17:00
Dienstag, 16. Dezember 2014 10:30 bis 17:00
Mittwoch, 17. Dezember 2014 10:30 bis 17:00
Donnerstag, 18. Dezember 2014 9:00 bis 17:00
Freitag, 19. Dezember 2014 9:00 bis 17:00


Mittwoch, 7. Januar 2015 10:30 bis 17:00
Donnerstag, 8. Januar 2015 9:00 bis 17:00
Freitag, 9. Januar 2015 9:00 bis 17:00


Montag, 12. Januar 2015 9:00 bis 17:00
Dienstag, 13. Januar 2015 10:30 bis 17:00

 

Literatur

Methods in Molecular Biology, vol. 363: Macromolecular Crystallography Protocols: Volumes 1 + 2: Preparation and Crystallization of Macromolecules Edited / Structure Determination by: S. Doublié © Humana Press Inc., Totowa, N (2007) (als pdf verfügbar)
Protein Crystallization (2009) by Therese M. Bergfors 

 

Seminar

Mittwoch 3.12.2014 10:15 Uhr bis 11:00 Uhr mit zwei Vorträgen je 10 min

Mittwoch 10.12.2014 10:15 Uhr bis 11:00 Uhr mit zwei Vorträgen je 10 min

 

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