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F2 Praktikum Protein Kristallisation, Wintersemester 2013 2014

proteincrystals

F2 Praktikum 2. Block

Fan Zhang und Tilman Lamparter

Weiteres Material hier. 

Fragensammlung zur Vorbereitung auf Klausur.

Programm

 Vorlesung und Seminar finden auf deutsch statt, manche Folien sind auf englisch. Das Seminar findet im Raum 002 der Botanik 1 (Geb. 10.40) statt.

  Vorlesung Seminar Gruppe 1 Gruppe 2 Gruppe 3 Gruppe 4
       wochenweise      
Montag, 25. November 2013 10:30: Einführung   PhrB Y424F PhrB Y424F Agp2-M1 Agp2-M1
Dienstag, 26. November 2013 10:30 Protein Techniken   Kristallisation Kristallisation Kristallisation Kristallisation
Mittwoch, 27. November 2013 10:00 DNA Techniken   Vorbereitungen Vorbereitungen Reinigung Reinigung
Donnerstag, 28. November 2013 Kristallisation 1   Expression Expression Mutagenese Mutagenese
Freitag, 29. November 2013            
Montag, 2. Dezember 2013     Kristallisation Kristallisation Kristallisation Kristallisation
Dienstag, 3. Dezember 2013   10:30 Thema 1 Reinigung Reinigung Expression Expression
Mittwoch, 4. Dezember 2013 10:00 Phytochrom   Mutagenese Mutagenese Reinigung Reinigung
Donnerstag, 5. Dezember 2013   10:00 Thema 3        
Freitag, 6. Dezember 2013   10:00 Thema 4        
Montag, 9. Dezember 2013 10:30 Phytochrom   Kristallisation Kristallisation Reinigung Reinigung
Dienstag, 10. Dezember 2013 10:30 Phytochrom   HPLC mit DNA HPLC mit DNA Kristallisation Kristallisation
Mittwoch, 11. Dezember 2013   Thema 5+6 Photoreparatur Photoreparatur Charakterisierung Charakterisierung
Donnerstag, 12. Dezember 2013  10:00 Photolyase
 
    Agp2-M1 Agp2-M1
Freitag, 13. Dezember 2013   10:00 Thema 7+ 8
       
Montag, 16. Dezember 2013     Reinigung Reinigung Kristallisation Kristallisation
Dienstag, 17. Dezember 2013     Kristallisation Kristallisation Charakterisierung Charakterisierung
Mittwoch, 18. Dezember 2013   10:00 Referate     Agp2-M1 Agp2-M1
Donnerstag, 19. Dezember 2013  
       
Freitag, 20. Dezember 2013   10:30 Klausur        

Themen für Seminar (ein Thema pro Studierender)

Macromolecular Crystallography Protocols Band 1+2, 2007 (Bücher in der Botanik 1, Raum 001, pdf Version hier. )

Thema 1: A Generic Method for the Production of Recombinant Proteins in Escherichia coli Using a Dual Hexahistidine-Maltose-Binding Protein Affinity Tag. Joseph E. Tropea, Scott Cherry, Sreedevi Nallamsetty, Christophe Bignon, and David S. Waugh     Bd. 1,pp. 1-20

Thema 2: Protein Engineering. Sonia Longhi, François Ferron, and Marie-Pierre Egloff; Bd. 1,pp. 59-90

Thema 3: Production of Selenomethionyl Proteins in Prokaryotic and Eukaryotic Expression Systems. Sylvie Doublié; Bd. 1, pp. 91-108

Thema 4: Screening and Optimization Methods for Nonautomated Crystallization Laboratories. Terese Bergfors; Bd. 1, pp. 131-152

Thema 5: Improving Marginal Crystals. Charles W. Carter, Jr. and Madeleine Riès-Kautt; Bd. 1, pp. 153- 174

Thema 6: Cryocrystallography  of  Macromolecules: Practice and Optimization. Elspeth Garman and Robin L. Owen; Bd. 2, pp.        1-18

Thema 7: Characterizing a Crystal From an Initial Native Dataset. Michael R. Sawaya ; Bd. 2, pp. 95-120

Thema 8: Molecular  Replacement. Eric A. Toth; Bd. 2, pp.        121-148

 

 

Teilnehmer und Themen

 

Die Themen sind unter "Seminar" aufgelistet. An den jeweiligen Tagen stellen die Teilnehmer den zugeteilten Artikel vor. Dauer 15-30 min.  

 

Gruppe A:

Reuster, Jennifer: 6

Sülzle, Anja: 3

 

Gruppe B:

Epple, Philipp: 4  

Pinecker, Christoph: 5

 

Gruppe C:

Nikoloff, Jonas: 8

Bai, Yingnan: 2?

 

Gruppe D:

Knott, Jenny: 1

Setzer, Tabea: 7